GapPenalty

GapPenalty

SequenceAlignmentおよび関連関数のオプションで，連続する挿入あるいは削除に対応する各ギャップに関連した追加コストを与える

詳細

  • GapPenalty->p は，列の類似度は列を揃えるために必要な一連の挿入あるいは削除のそれぞれから抽出した量 p を持たなければならないと指定する．

例題

例  (2)

デフォルトで，アラインメントには2つのギャップが伴う：

ギャップの追加コストを増すと他のギャップが少なくなる：

デフォルトのアラインメントスコア：

ギャップに追加コストを加える：

Wolfram Research (2008), GapPenalty, Wolfram言語関数， https://reference.wolfram.com/language/ref/GapPenalty.html.

テキスト

Wolfram Research (2008), GapPenalty, Wolfram言語関数， https://reference.wolfram.com/language/ref/GapPenalty.html.

CMS

Wolfram Language. 2008. "GapPenalty." Wolfram Language & System Documentation Center. Wolfram Research. https://reference.wolfram.com/language/ref/GapPenalty.html.

APA

Wolfram Language. (2008). GapPenalty. Wolfram Language & System Documentation Center. Retrieved from https://reference.wolfram.com/language/ref/GapPenalty.html

BibTeX

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BibLaTeX

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