GenomeLookup

GenomeLookup["seq"]

参考人类基因，返回精确匹配的 DNA 序列 seq 的坐标.

GenomeLookup["seq",n]

返回最多 n 个匹配.

更多信息

  • 字符串形式表示的序列包含 A、T、G、C 或 A、U、G、C.
  • GenomeLookup["seq"] 返回的坐标以 {{"chr",strand},{p1,p2}} 的形式给出，其中 "chr" 是一个染色体指定，strand 是 +1 或 -1，p1 和 p2 是起始和末端坐标.
  • 人类染色体由 "Chromosome1"、"ChromosomeX"、"Mitochondrion" 指定.
  • 基的编号是指定带的 5' 到 3' 方向.
  • GenomeLookup[spec,"Count"] 给出明确匹配的数的统计.

范例

基本范例  (3)

求出人类基因上一个 DNA 序列片断的坐标：

获得匹配的数量：

获得前 10 个匹配：

Wolfram Research (2008)，GenomeLookup，Wolfram 语言函数，https://reference.wolfram.com/language/ref/GenomeLookup.html.

文本

Wolfram Research (2008)，GenomeLookup，Wolfram 语言函数，https://reference.wolfram.com/language/ref/GenomeLookup.html.

CMS

Wolfram 语言. 2008. "GenomeLookup." Wolfram 语言与系统参考资料中心. Wolfram Research. https://reference.wolfram.com/language/ref/GenomeLookup.html.

APA

Wolfram 语言. (2008). GenomeLookup. Wolfram 语言与系统参考资料中心. 追溯自 https://reference.wolfram.com/language/ref/GenomeLookup.html 年

BibTeX

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