AgilentMicroarray (.txt)

背景

    • Agilent 微阵列数据格式.
    • 用于存储和交换微阵列数据和元信息的文件格式.
    • ASCII 格式.
    • Agilent Feature Extraction 和 Agilent Genomic Workbench (AGW) 软件的输出格式.
    • 包含3个子表格，存储 Feature Extraction 参数，微阵列级的统计和特征级的数据.

Import

  • Import["file","AgilentMicroarray"] 从任何 Agilent 微阵列文件中导入数据.
  • Import["file",{"AgilentMicroarray",elem}] 导入指定参数.
  • Import["file",{"AgilentMicroarray",{elem1,elem2,…}}] 导入多个参数.
  • Import["file",{"AgilentMicroarray",elem,subelem}] 指定导入的子参数.
  • Import["file",{"AgilentMicroarray",elem,{subelem1,subelem2,…}}] 导入多个子参数.
  • 请到以下参考页面了解完整的基本信息：
  • Import从文件导入
    CloudImport从云对象导入
    ImportString从字符串导入
    ImportByteArray从字节数组导入

导入参数

  • Import 的通用参数：
  • "Elements" 该文件可用的参数和选项列表
    "Summary"文件摘要
    "Rules"所有可用参数的规则列表
  • 表示常用数据的参数：
  • "FeatureTable"原始特征表
    "LabeledFeatureTable"以规则列表表示的特征表
  • 元信息参数：
  • "Header"以规则列表表示的 Feature Extraction 参数
  • 全阵列统计参数：
  • "Statistics"以规则列表表示的全阵列
  • 使用 Import["file",{"AgilentMicroarray",elem,"Elements"}] 列出3个主表 （"LabeledFeatureTable", "Header", "Statistics"）中每个可用的子参数.
  • 默认情况下，Import 使用 "FeatureTable" 参数.

范例

打开所有单元关闭所有单元

基本范例  (2)

导入全阵列统计量：

导入在 Feature Extraction 软件中使用的参数：

列出每个特征可用的数据：

导入多个特征的基因名称和对数比例：

范围  (1)

创建一个基于探针的 折叠变化的微阵列的数字渲染：