BioMoleculeValue

BioMoleculeValue[biomol,prop]

返回 BioMolecule biomol 的属性 prop 的值.

BioMoleculeValue[biomolpart,prop]

返回与 biomol 的 part 关联的属性值.

更多信息

  • 对于形式为 BioMoleculeValue[biomolpart,prop] 的输入，part 应为一个 Association，其键和默认值为：
  • "Model"1使用哪个模型
    "Chains"All包含哪些链
    "Residues"All包括哪些残基
    "Atoms"All包含哪些原子
  • 以下是一些常用属性：
  • "Name"生物分子名称
    "BioSequence"类型为 "HybridStrand" 的 BioSequence
    "ModelCount"模型的数量（通常为 1）
    "Models"BioMolecule 对象列表，每个对象有一个模型
    "AssemblyCount"组装的数量
    "AssemblyData"组装的数据
    "Assemblies"BioMolecule 对象列表，每个对象有一个组装
    "CrystallographicSpaceGroup"晶体空间群
    "ComputedStructureQ"如果 biomol 是预测的结构，给出 True
    "PDBString"以 "PDB" 格式表示 biomol 的字符串
    "MMCIFString"以 "MMCIF" 格式表示 biomol 的字符串
  • 以下属性适用于模型：
  • "ChainCount"链的数量
    "ChainLabels"链的标签的列表，如 {"A","B",…}
    "PolymerChainCount"聚合物链的数量
    "PolymerChainLabels"聚合物链标签的列表
    "ResidueCount"所有链中的残基的数量
  • 以下属性适用于链，结果以 Association 形式返回，其中的键为链的标签：
  • "ResidueCounts"每条链的残基的数量
    "ResidueLabels"残基标签的列表，如 {"GLY","PRO",…}
    "ResidueIDs"数字标识符
    "AtomCounts"每条链上原子的数量
  • 以下属性适用于残基，结果以 Association 形式返回，其中，键为链的标签，值是列表的列表，每个残基一个：
  • "AtomicSymbols"原子的符号
    "AtomCoordinates"带单位的原子坐标，封装在 QuantityArray 中
    "AtomCoordianteValues"以埃为单位的原子数字坐标
    "AtomLabels"每个原子的标签，如 {"CA","CB",…}

范例

基本范例  (1)

根据 ExternalIdentifier 创建生物分子：

求模型的数量：

给出每个模型中残基 3 中第一个原子的坐标：

可视化原子的位置：

Wolfram Research (2024)，BioMoleculeValue，Wolfram 语言函数，https://reference.wolfram.com/language/ref/BioMoleculeValue.html.

文本

Wolfram Research (2024)，BioMoleculeValue，Wolfram 语言函数，https://reference.wolfram.com/language/ref/BioMoleculeValue.html.

CMS

Wolfram 语言. 2024. "BioMoleculeValue." Wolfram 语言与系统参考资料中心. Wolfram Research. https://reference.wolfram.com/language/ref/BioMoleculeValue.html.

APA

Wolfram 语言. (2024). BioMoleculeValue. Wolfram 语言与系统参考资料中心. 追溯自 https://reference.wolfram.com/language/ref/BioMoleculeValue.html 年

BibTeX

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BibLaTeX

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