NeedlemanWunschSimilarity

NeedlemanWunschSimilarity[u,v]

给出一个数，表示字符串、向量或生物分子序列 u 和 v 之间的 Needleman–Wunsch 相似性.

更多信息和选项

  • NeedlemanWunschSimilarity[u,v] 在 u 和 v 的元素之间求出一个最佳的全局对齐，并返回单个元素 (one-element) 匹配的数量.
  • 对于字符串，设置选项 IgnoreCase->True 使得 NeedlemanWunschSimilarity 忽略大小写.
  • 缺省设置 SimilarityRules->Automatic 下，两个字符的每次匹配使得总的相似性分数加 ，而每次不匹配、插入或删除则使得总的相似性分数 .
  • 对于每次插入或删除，选项 GapPenalty 指定从相似性得分中减去一定分数.

范例

打开所有单元关闭所有单元

基本范例  (3)

两个字符串之间的 Needleman–Wunsch 相似性：

两个向量之间的 Needleman–Wunsch 相似性：

两个生物分子序列之间的 Needleman–Wunsch 相似性：

选项  (1)

SimilarityRules  (1)

"SimilarDegenerateBases" 设置允许匹配生物分子序列中的简并项，从而获得更高的相似性分数：

Wolfram Research (2008)，NeedlemanWunschSimilarity，Wolfram 语言函数，https://reference.wolfram.com/language/ref/NeedlemanWunschSimilarity.html （更新于 2020 年）.

文本

Wolfram Research (2008)，NeedlemanWunschSimilarity，Wolfram 语言函数，https://reference.wolfram.com/language/ref/NeedlemanWunschSimilarity.html （更新于 2020 年）.

CMS

Wolfram 语言. 2008. "NeedlemanWunschSimilarity." Wolfram 语言与系统参考资料中心. Wolfram Research. 最新版本 2020. https://reference.wolfram.com/language/ref/NeedlemanWunschSimilarity.html.

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Wolfram 语言. (2008). NeedlemanWunschSimilarity. Wolfram 语言与系统参考资料中心. 追溯自 https://reference.wolfram.com/language/ref/NeedlemanWunschSimilarity.html 年

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