CDX (.cdx)

予備知識

    • MIMEタイプ:chemical/x-cdxChemDraw Exchange形式.
    • CambridgeSoft CorporationのChemDrawアプリケーションにおいて分子データの保存に使用される.
    • バイナリ形式.
    • 二次元原子座標,化学結合情報,およびメタデータを保存する.

Import

  • Import["file.cdx"]はCDXファイルを分子としてインポートする.
  • CDXファイルの二次元座標はAtomDiagramCoordinatesオプション値の分子に保存される.
  • インポートされた分子 mol からは mol["AtomDiagramCoordinates"]を使って座標が取り出せる.
  • 一般的な情報は,以下の関数ページを参照のこと.
  • Importファイルからインポートする
    CloudImportクラウドオブジェクトからインポートする
    ImportString文字列からファイルからインポートする
    ImportByteArrayバイト配列からインポートする

Import要素

  • 一般的なImport要素:
  • "Elements" ファイル中の有効な要素とオプションのリスト
    "Summary"ファイルの概要
    "Rules"使用可能なすべての要素の規則のリスト

例題

  (2)

CDXファイルを分子としてインポートする:

分子を2D構造図で示す:

ファイルから読み込まれた座標と立体情報はAtomDiagramCoordinatesおよびAtomDiagramCoordinatesのオプション値に保存される:

CDXファイルから対称型トリグリセリドのモデルをインポートする:

分子を2D構造図で示す: