CDXML (.cdxml)

背景

    • MIME 类型：chemical/x-cdxmlChemDraw Exchange 格式 XML 版本的 CDX.
    • 代表任意数量的化合物.
    • XML 格式.
    • 存储原子坐标，化学键信息和元数据.

Import 与 Export

Import 参数

  • Import 的通用参数：
  • "Elements" 该文件可用的参数和选项列表
    "Summary"文件摘要
    "Rules"所有可用参数的规则列表

Options

范例

打开所有单元关闭所有单元

基本范例  (3)

从 CDXML 文件导入芴衍生物：

在二维结构图中显示分子：

从 CDXML 文件导入对称甘油三酸酯模型：

在二维结构图中显示分子：

将分子导出为 CDXML 文件：

导出选项  (1)

IncludeHydrogens  (1)

在默认设置为 IncludeHydrogensAutomatic 的情况下，与碳原子相连的氢原子被视为隐式的，不会导出到文件中。对于辛醇，显式包括仅直接与氧原子连接的氢：

要在输出文件中包含所有原子，请使用 IncludeHydrogensTrue：

请注意，当所有原子都布置好后，除非绘制出所有氢，否则结构可能看起来不正确：

使用 MoleculePlot 的 PlotTheme 选项可以显示所有原子：