FCHK (.fchk)

予備知識

    • MIMEタイプ：chemical/x-gaussian-checkpointGaussian形式のチェックポイントファイル．
    • バイナリチェックポイントファイルのプレーンテキスト版．
    • 量子化学計算の結果の保存に使用される．
    • テキスト形式．
    • Gaussian, Inc.によって保守されている．

Import

  • Import["file.fchk"]はFCHKファイルをMoleculeオブジェクトとしてインポートする．
  • Importについての一般的な全情報は関数ページを参照のこと．
  • ImportStringはFCHK形式をサポートする．
  • 一般的な情報は，以下の関数ページを参照のこと．
  • Importファイルからインポートする
    CloudImportクラウドオブジェクトからインポートする
    ImportString文字列からファイルからインポートする
    ImportByteArrayバイト配列からインポートする

Import要素

  • 一般的なImport要素：
  • "Elements" ファイル中の有効な要素とオプションのリスト
    "Summary"ファイルの概要
    "Rules"使用可能なすべての要素の規則のリスト
  • データ要素：
  • "Molecule"分子モデルの記号表現
    "Metadata"ファイルの結果を含むAssociation
  • 分子軌道エネルギーや占有等の結果は"Metadata"に保存される．
  • 計算結果は"Molecule"要素にも含まれる．結果を分子 mol から取り出すためには mol["MetaInformation"]を使用する．
  • ファイルの三次元座標は分子のAtomCoordinatesオプション値に保存される．
  • インポートされた分子 mol からは mol["AtomCoordinates"]を使って座標が取り出せる．

例題

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例  (1)

FCHKファイルを分子としてインポートする：

分子を3Dで表示する：

双極子と軌道の情報は分子のMetaInformationに保存される：

スコープ  (2)

分子をインポートして双極子モーメントの計算結果を得る：

分子の3Dプロットとともに双極子を示す：

分子のバンドギャップに対応する光の波長を，方程式を使って求める：

分子をインポートして双極子モーメントの計算結果を得る：

最低空軌道(LUMO)と最高被占軌道(HOMO)を求める：

HOMOからLUMOに電子が励起するのに必要なエネルギーを求める：

FormulaDataを使って波長に変換する：

結果をナノメートルに変換する：

結果を色で可視化する：