グラフのアノテーションは属性とも呼ばれ，頂点，辺，およびグラフ自体に関連付けられた値を設定し，保存するのに使用される．標準のアノテーションは通常グラフモデリング機能を拡張するスタイル，ラベル，重みに関連し，グラフ関連関数によって自動的に処理される．ユーザ定義のアノテーションを利用すると，グラフモデリングをさらに拡張することが可能になる．

アノテーションの取得と設定

Annotation — 頂点と辺のアノテーションラッパー

AnnotationValue — 頂点または辺のアノテーション値を取得したり設定したりする

AnnotationKeys  ▪  Annotate  ▪  AnnotationDelete  ▪  AnnotationRules

標準のアルゴリズム的アノテーション

EdgeWeight，VertexWeight — 辺と頂点の重み

EdgeCapacity，VertexCapacity — 辺と頂点の容量

WeightedAdjacencyMatrix  ▪  WeightedAdjacencyGraph  ▪  WeightedGraphQ  ▪  EdgeWeightedGraphQ  ▪  VertexWeightedGraphQ

標準の視覚的アノテーション

EdgeShapeFunction，EdgeStyle，EdgeLabels — 辺を描画する，辺のスタイルを設定する，辺にラベルを付ける

VertexShapeFunction，VertexStyle，VertexLabels — 頂点を描画する，頂点のスタイルを設定する，頂点にラベルを付ける

GraphLayout, GraphHighlightStyle — グラフをレイアウトする，グラフのスタイルを設定する，グラフをハイライトする

VertexShape  ▪  VertexCoordinates  ▪  VertexSize  ▪  GraphHighlight

ユーザのアノテーション

"myannotation" — 頂点，辺，グラフの新しいアノテーションを指定する

AnnotationValue  ▪  AnnotationKeys  ▪  Annotation