Wolfram言語は3Dデータ集合の立体描画と処理の組込みサポートを提供する．画素操作，局所フィルタリング，分割形態学的操作を含む多数の組込みの画像処理アルゴリズムを3Dデータ集合に適用することができる．

3Dデータは1つのファイルあるいは一連のファイルからインポートすることができる．通常スライスは2D画像のスタックとして保存され，それを組み合せて3D画像を生成することができる．3D画像は三次元または四次元のデータ配列から生成することもできる．ここで最初の3つの次元は，デフォルトでは3D画像のスライス，行，列に対応する．

立体の内部を表すには，3Dの立体の2Dスライスを表示すると便利である．Image3DSlicesは，指定された次元の立体の2Dスライスを抽出する．

3D画像のプロパティは次の関数を呼び出すことで得ることができる．

立体描画では，伝達関数がボクセル値を対応する不透明度や色の値に変換する．Wolfram言語では，伝達関数はColorFunctionオプションを使って指定することができる．

立体の内部を見るためには，通常立体の一部を切り取らなければならない．ClipRangeオプションはビューから切り取る長方形を指定するのに使うことができる．

3D立体を描画するときは，デフォルトでは背景色は指定されていないため，ノートブックの背景色が使われる．

デフォルトでは，各ボクセルは正立方体と想定される．したがって，描画された立体のボックス比はその次元の比に比例する．

データが立方体のボクセルを示さない場合，立体を埋め込むボックスの比はBoxRatiosオプションを使って指定することができる．

データの配列から立体を構築する場合，デフォルトでは最初の三次元はそれぞれ3D画像のスライス，行，列に対応する．スライスは上から下に，行は後ろから前に，列は左から右に列挙される．

これを覚えるには，3D空間に本を置いた場合を考えるとよい．本のページは画像のスライス（上から下）に対応し，各ページ（画像のスライス）に対応するデータは行が後ろから前に，左から右に並ぶように配列される．

2D画像と同様に， 3D画像の場合も使用される座標系は複数ある．3D空間にデータ配列を埋め込むために使われる座標系は，Wolfram言語の部分指定と同じである．

画像とデータ配列の両方に作用するWolfram言語コマンドは，指標座標系に従う．3Dではこれらのコマンドはまず，上から下に走る垂直のスライス座標を参照するパラメータをリストし，後ろから前の行座標をリストし，左から右の列座標をリストする．

2つ目の座標系はデータに備わってはおらず，埋込み空間に付随している．Graphics3D座標系のような連続画像座標系は画像の下，左，前の角に原点があり， 座標は左から右に， 座標は前から後ろに， 座標は下から上に伸びている．画像領域は3Dの区間××をカバーする．

任意の配列に適用可能な画像処理コマンドは，標準的な画像座標に結果を描画する．これらの標準的な画像座標はGraphics3Dプリミティブで使うことができる．